К освоению программы ординатуры Акушерство и гинекология, Дерматовенерология , Онкология, Неврология, Хирургия, Эндокринология, Офтальмология, Урология допускаются лица, имеющие высшее медицинское образование по специальностям Лечебное дело, Педиатрия.

Для поступления в ординатуру по программе Стоматология общей практики, Стоматология хирургическая, Стоматология ортопедическая необходимо иметь высшее медицинское образование по специальности Стоматология.

Вступительные испытания проходят очно в форме тестирования, либо с использованием дистанционных технологий при условии обеспечения Институтом идентификации личности поступающего.

Обучение проходит в малых группах под руководством опытных научно-педагогических работников. Учебно-методическое, информационное и материально-техническое обеспечение программ ординатуры  в полной мере соответствует требованиям федеральных государственных  образовательных стандартов.

Электронно-библиотечные системы и электронная информационно-образовательная среда обеспечивают доступ обучающихся из любой точки, в которой имеется доступ к информационно-телекоммуникационной сети «Интернет», как на территории Института, так и вне его. Для самостоятельной работы ординаторов предоставляются помещения, оснащенные компьютерной техникой с возможностью подключения к информационно-телекоммуникационной сети «Интернет».

Отработка практических навыков проходит в оборудованных центрах Института (Центр симуляционного обучения, Центр стоматологического образования) и в ведущих учреждениях здравоохранения Санкт-Петербурга.